Registreerunud meeskonnad jagati vastavalt 2019/2020 hooaja põhiturniiri paremusjärjestuste reitingule kolme erinevasse loosipotti.

Loosipottides B ja C asetsevad võistkonnad loositi paaridesse ning nemad alustavad võistlemist 1/16- finaalist.

1/16-finaalpaarid:
1) Ehton/Fööniks - G4S Noorteliiga
2) KK Viimsi/Noto – Kose 2020
3) Rae Koss/Hansaviimistlus – Reinar Halliku Korvpallikool/Iisaku
4) Kadrina Karud – BC Torm
5) Tartu Kalev/Estiko – BC Viljandi vald/Eesti Maavara
6) Nord/Cramo – Rapla Korvpallikool
7) Tamsalu Los Toros/TALTECH – Alexela Mediq Eesti
8) Keila Korvpallikool – Terminal Oil

Loosipotist A loositi kaheksa kõrgema reitinguga võistkonda automaatselt kaheksandikfinaalidesse järgmises asetuses:
1) Rakvere Tarvas
2) KA Tallinna Kalev/TSK
3) Pärnu Sadam
4) TALTECH
5) BC Kalev/Cramo
6) Tartu Ülikool
7) Rapla AVIS UTILITAS
8) Tallinna Kalev/TLÜ

1/16-, kaheksandik- ja veerandfinaalmängud peetakse kahest mängust parim (kodus-võõrsil) süsteemis. Seejuures esimene mäng peetakse nõrgema asetusega meeskonna kodus ja teine mäng kõrgema asetusega meeskonna kodus.

1/16-finaalid mängitakse ajavahemikus 10.-18. september, kaheksandikfinaalid 19.-27. septembril ja veerandfinaalid vahemikus 29. septembrist 7. oktoobrini. Nelja võistkonnaga finaalturniir mängitakse 19. ja 20. detsembril.

Superkarika turniiri korraldavad Eesti Korvpalliliit ja MTÜ Rahvaliiga.